Роден в София, България. Завършва Средното музикално училище „Любомир Пипков“ – София с пълно отличие и медал на Министерството на просветата на България. През 1993 г. с пълно отличие завършва и Държавната музикална академия „Панчо Владигеров“, в класа по цугтромбон на проф. д-р Димитър Момчилов. През 1992 г. участва в майсторския курс на проф. Франц Вайлнхамер в Исерлон, Германия. 

През 1995 г. завършва двегодишна специализация по цугтромбон в майсторския клас на проф. д-р Димитър Момчилов, а през 1996 г. – двегодишна специализация по камерна музика в майсторския клас на проф. Костадин Чилев в Държавната музикална академия „Панчо Владигеров“. 

През 1996 г. специализира в Chicago Symphony Orchestra, Chicago Chamber Musicians и De Paul University в Чикаго, САЩ. През 2022 г. с пълно отличие завършва Академията за музикално, танцово и изобразително изкуство „Проф. Асен Диамандиев“, в класа по оркестрово дирижиране на доц. Кирил Чапликов.

От 1990 г. до 1993 г. е първи тромбонист на Академичния симфоничен оркестър на Държавната музикална академия „Панчо Владигеров“. В периода 1996-2009 г. е солист-водач на тромбоновата група в Оркестъра на Софийската опера и балет. Бил е солист на камерни и симфонични оркестри в България и в чужбина.

От 1993 г. е преподавател по цугтромбон и камерна музика в Националното музикално училище „Любомир Пипков“ – София, а от 1994 г. до 2015 г. е асистент в катедра „Медни духови и ударни инструменти“ в Инструменталния факултет на Националната музикална академия „Проф. Панчо Владигеров“. От 2020 г. е преподавател по цугтромбон и камерна музика в Департамент „Музика“ на Нов български университет. Негови ученици и студенти са награждавани многократно на престижни национални и международни конкурси.

Лауреат е на Четвъртия национален конкурс за камерна музика „Златната Диана“ – Ямбол, 1986 г. и един от създателите на камерен ансамбъл „Академик брас“. Носител е на Наградата за високи педагогически постижения от Международния конкурс за изпълнение на немска и австрийска музика „M.A.G.I.C.” – Бургас, 2001 г., 2007 г., 2013 г., 2015 г. и от Националния конкурс за инструменталисти и певци „Светослав Обретенов“ – Провадия, 2014 г.

Член е на International Trombone Association и на Historic Brass Society в Ню Йорк, САЩ. От 2015 г. е председател на Съюза на българските музикални и танцови дейци.

Роден в Пловдив, Стефан Чапликов дебютира с камерен ансамбъл „Софийски солисти“, изпълнявайки Клавирния концерт в ре минор BWV 1052 на Й. С. Бах. През 2006 се дипломира с отличен успех в НУМТИ „Добрин Петков“ в класа по пиано на Елена Велчева. Завършва Консерваторията в Париж при Мишел Бероф и продължава обучението си в The Glenn Gould School в Торонто като част от програмата Rebanks Family Fellowship, работейки с Джон Пери. Получава Artist Diploma в Yale School of Music под ръководството на Петер Франкл и завършва докторската си степен в Института „Пийбоди“ към Университета „Джонс Хопкинс“, където учи при Леон Флайшер.

Стефан Чапликов получава широко признание от критиката за своите изпълнения в Европа, Северна Америка и Азия, утвърждавайки се като многостранен музикант – солист, камерен изпълнител и педагог. Той е свирил в зали като Salle Cortot и Musée de l'Armée в Париж, Musée des Augustins de Toulouse, Зала „България“ в София, Palacio de Festivales de Cantabria в Сантандер, Richard Bradshaw Amphitheatre и Koerner Hall в Торонто, както и Morse Recital Hall в Йейлския университет.

Неговият запис – солов албум с клавирни сонати на Клементи – издаден от Naxos, е посрещнат с възторжени отзиви от критиката, която го описва като „зашеметяващо красив“ (American Record Guide), „истинско музикално удоволствие“ (Ritmo) и „абсолютно съвършенство“ (The WholeNote). Други негови записи включват албума Brahms, Variations от колекцията „Млади солисти“ на Консерваторията в Париж, съдържащ клавирните вариации на Йоханес Брамс, както и изпълнение на Соната оп. 106 „Хамерклавир“ от Бетовен, записано в Koerner Hall в Торонто.

Стефан е участвал в множество престижни музикални фестивали и академии, включително Международен фестивал Варненско Лято 2025,  58-ия Международен фестивал за камерна музика в Пловдив, 53-ия Международен музикален фестивал „Софийски музикални седмици“, III Международен музикален фестивал „Strive“ в Царския дворец Врана в София, The International Holland Music Sessions, Weimar Master Classes, The Banff Centre, Encuentro de Música y Academia Santander, Académie de Musique Lausanne и Festival International des Jeunes Étoiles Paris. Участвал е в майсторските класове на Пиер-Лоран Емар, Ричард Гуд, Стивън Хъф, Фу Тс'онг, Дмитрий Башкиров, Бруно Канино, Борис Берман, Идил Бирет, Ерик Хейдзик, Арие Варди и Джон О’Конър.

Стефан е изнасял лекции и майсторски класове в България, Австрия, Мексико, Хонг Конг, САЩ, Китай и Франция. В момента е гост-професор в Департамент за музика и медии към Университета в Шенян, Китай, професор по пиано в Департаменталната Консерватория Bourg-la-reine, Франция, и ментор по пиано в Tonebase. Преди това е бил преподавател в Консерваторията на Chateauroux, Франция и пиано инструктор в Йейлския университет.